信息科学系是上海立信会计学院在信息时代组建而成的。
信息科学系以上海经济建设和社会发展的需要设置专业。现有计算机科学与技术、信息管理与信息系统两个本科专业，计算机信息管理（中日合作）专科专业。在原计算中心基础上，现设有计算机基础教研室、计算机科学教研室、信息系统教研室、学科研究室、实验中心等部门。在学校的大力支持下，又大量引进了具有高职称、高学历的教师，现教师队伍中正教授占29%、博士占29%，已形成了一支教学严谨、科研并重、爱岗敬业的师资队伍。
信息科学系培养目标是 “厚基础、宽口径、重应用”，具有创新精神、实践能力和适应性强的人才。现已建立上海软件园（浦东）、长江计算机（集团）公司、上海计算机软件开发中心、太平洋机电（集团）有限公司等校外实习基地。
信息科学系除了承担本系所有专业的教学任务外，还承担着全校计算机基础、信息管理等课程的教学工作。本系拥有540台戴尔微机，可满足学生教学、上机实习和课余创新活动的需要。
计算机科学与技术专业（本科）
本专业培养能系统地掌握计算机科学与技术的基本理论与基本知识，基础扎实、知识面广，系统地掌握本专业的基本技能与方法，能熟练地进行程序设计；能使用数据库技术、网络技术和多媒体技术解决实际问题的能力；有一定的开发计算机应用系统能力和创新能力；受到良好的科学研究和实际应用训练，具有一定的本专业领域科学研究能力；掌握一定的财会、经济、金融、管理等知识，具备综合运用所学知识分析和解决问题的基本能力。能在科研、教育、企业、事业、技术和行政管理部门等单位从事计算机教学、科学研究和应用的计算机科学与技术学科的高级专门科学技术人才。
信息管理与信息系统专业（本科）
本专业实行“厚基础、宽口径、重应用”教学培养模式，在人才的培养上坚持管理科学与信息技术的有机结合，理论与实践的有机结合，教学与应用的有机结合；避免信息技术、管理学科、数学等知识的简单累加，在专业建设中形成自己的特色。本专业培养具备现代管理学理论基础、计算机科学技术知识及应用能力，掌握系统思想和信息系统分析与设计方法以及信息管理等方面的知识与能力，能够在国家各级管理部门、工商企业、金融机构、科研单位等部门从事信息管理及信息系统分析、设计、实施和评价等方面工作的，具有创新精神、实践能力和适应性强的高级管理人才。
计算机信息管理专业（中日合作、专科）
本专业为上海立信会计学院信息科学系与日本千叶商科大学信息策划学院合作举办的三年制专科专业。本专业培养目标：强化外语教学，精通日语，培养从事计算机应用、信息处理系统开发与维护、具有一定的计算机科学理论基础、柔性的思考能力与适应计算机技术发展的创新能力以及适应计算机宽口径领域技术具有国际意识和视野、复合型、创新型的高级专门人才。本专业三分之一的专业课程由外籍教师讲授。在上海立信会计学院学习三年毕业后可获上海立信会计学院《计算机信息管理》专业大专文凭，通过日本千叶商科大学入学面试后，可进入日本千叶商科大学信息策划学院三年级继续深造两年，毕业后可获日本千叶商科大学信息策划专业本科文凭。本专业学生在读期间符合规定的条件，经选拔，每年有2人可获一年赴日本千叶商科大学游学的机会，游学期间免除在日本学习的学费和住宿费。